Se vuoi recuperare i tuoi dati devi riflashare un firmware originale e recuperare il backup da Kies, installare un'app per i backup (posso consigliarti Titanium), backuppi solo i dati utenti e gli eventuali dati, flashi il nuovo firm, reinstalli l'app e ripristini tutte le tue app e dati.
Per un'installazione pulita si consiglia di reinstallare le app dal market, io l'ultima volta ho fatto tutto in blocco per scarso tempo a disposizione e non ho avuto ancora problemi!