Le cartelle le puoi cancellare dalla TWRP che sicuramente non ti fa storie, riavvii in recovery e da Advanced -> File Manager ti sposti dove vuoi (ad esempio l'archivio interno è in /data/media/0) ed elimini quello che non ti serve.
Per cambiare le scorciatoie nella schermata di blocco, vai in Impostazioni -> Sicurezza -> Tap sull'ingranaggio a fianco di "Blocco schermo" -> Scorciatoie del blocco schermo. Come diceva anche @Randomaiz però c'è qualche bug con la visualizzazione delle icone in schermata di blocco quando cambi il collegamento, a volte quella di destra scompare dopo un riavvio anche se facendo lo swipe apre comunque l'app/attività selezionata. Essendo un bug non specifico del nostro device ma della base e comune a tutti su LineageOS, dovrebbe essere risolto in tempi abbastanza brevi.