Esatto: confermo che con partition puoi ridimensionare la partizione fat32 e, nello spazio che si libera, puoi creare la partizione ext (2 o 3 è a tua discrezione) sempre con partition magico.
Per ripristinare ti basta disinstallare, sempre da got, apps2sd e poi, con partition magico, elimini la extra e ridimensioni la fat32.
Una cosa che non so è se quando disinstalli apps2sd le applicazioni nella scheda vengono ritrasferite nella memoria telefono o se vengono cancellate...