Partiamo dalla fine, qui tutti hanno la versione 3g mi pare, però trattandosi del wifi non dovrebbero esserci differenze. A me non è mai apparso il punto esclamativo sull'icona wifi, né ho letto ad altri che succedeva. Al 99% non è un problema del telefono, ma della rete wifi a cui si collega (se è sempre la stessa). Probabilmente si tratta di un qualche tipo di impostazione del router che gli crea un conflitto, ma nulla di preoccupante se continua a funzionare.
Per controllare la versione installata non devi guardare nel menù, ma digitare nel tasterino il seguente codice: *#*#563412#*#*
In questo modo dovresti visualizzare la versione effettiva dell'aggiornamento.
L'aggiornamento integrale che trovi sul sito invece non è lo stesso che trovi ota, ma in realtà è la rom completa, e prevede il flash del telefono, cioè formattazione inclusi i settori relativi ai file di sistema tramite il relativo software. In questo caso ovviamente perdi tutto il contenuto presente sulla memoria interna.