Ecco su cosa ti stavi confondendo....una cosa è flashare la recovery stock (ossia installarla, o ripristinarla, o rimetterla).
Un'altra cosa è fare un backup della recovery stock (ossia salvarla e tenerla da parte).
Ovviamente se devi installare la recovery stock devi farlo dal prompt dei comandi....a meno che non installi una Ruu e te la rimette in automatico.