Se con Trickster MOD non avevi problemi, non riesco a capire perchè i problemi sorgono ora..
Entrambi modificano il valore del file "gpuclk" , contenuto nel percorso; /sys/device/platform/kgsl3d0.0/kgsl/kgsl-3d0.
Il kernel è quello stock, oppure è un custom? (generalmente alcuni custom, sporcano la init.d con script inutili, che agiscono indiscriminatamente anche sui permessi dei file)
Avevi già disabilitato il servizio thermal? /data/property/persist.sys.thermald_miti_off > true
ps: In caso il kernel non sia lo stock o cmq, l'utility TricksterMOD fà il suo dovere, consiglio allora di continuare ad usarla.
Ti eviti tutta la trafila manuale di andare a controllare file e script di sistema k?