Possibilmente, non è la tastiera non ripristinata, ma qualche impostazione ( importata dai dati del backup di qualche app che ne fa uso ) che va in conflitto con quella della rom. E magari per quel motivo quando vai nelle impostazioni va in fc.
L'unica per togliere ogni dubbio è provare la rom "nuda" ... se ti va bene, mi sa che dal backup, dovresti importare solo le app ( purtroppo non conosco Titanium, e non saprei dirti di più ).