Io farei un deep clean 1 per versione modem mg4 e successive, per pulire il tutto (tra l'altro ti tornerà anche 4.1.2 e potrai fare root e recovery Come conoscevi tu), poi procederei a nuova installazione, magari usando una recovery più recente e soprattutto riscaricando lo zip (non si sa mai)
Ovviamente hai provato a cancellare cache e dati dell'applicazione whatsapp da gestione applicazioni, vero?