Concordo con gli utenti di xda perché sono sicuro che l'aggiornamento delle nightly non cancella completamente e poi riscrive i file nella cartella di sistema (ho alcuno file che ho modificato personalmente e non cambiano facendo l'aggiornamento). Quindi potrebbe essere che se una nightly ti installa un file buggato e le nightly successive non lo risolvono rimane il bug anche negli aggiornamenti.
È una teoria, ma potrebbe spiegare perché a qualcuno rimangono gli stessi bug installando differenti versioni della rom: magari ha installato una nightly "sfigata" in passato.