Ciao. Oltre a quello che giustamente ti ha consigliato aaasss, se vuoi Flashare una qualsiasi Rom devi avere anche una Recovery Modificata, ottenibile dal CF Root idoneo alla Rom che monti.
Eseguendo un format Factory, Cache e Dalvik da Recovery NON cancelli nulla di ciò che hai sull'SD, sia interna che esterna. La tua CM o il tuo nandroid backup quindi non verranno rimossi nemmeno dopo i Format, tranquillo.
Il nandroid Backuo ti fa un'immagine del sistema, ma tieni conto che per ripristinarla ti dovrai trovare con la medesima Rom con cui lo hai creato. L'immagine è TOTALE, tranne che di ciò che è contenuto nell'SD (interna od esterna). Quello resta invariato.
Passando da un sistema ad un altro (GB ICS ad esempio) è sconsigliato usare Titanium per il ripristino delle App di Sistema soprattutto. Circa quelle personali puoi provare, al limite non funzioneranno e le dovrai riscaricare e ri settare come desideri.