Prego, non ti arriverà l'update ota, quella arriva solo a chi ha la 5.1 stock. Cambierà anche la versione delle librerie, che su Andorid 6 finale sarà a 64 bit contro i 32bit attuali della 5.1 e della beta 6.
Quando avrai la 6 ufficiale, flasha solo il system con flashtool e dovresti avere il sistema nuovi senza perdere app e recovery twrp