E' semplice
Il root varia i file di sistema. Quando l' OTA tenta di installare l'update trova i file originari , su cui dovrebbe intervenire , variati ed entra in conflitto.
Ma non ci sono grossi problemi, una volta avuta un poco di manualità con flashtool.
Basta reinstallare il system e la recovery originale , fare l'Ota e successivamente reinstallare la TWRP e rifare il root.
Sembra complicato ma ci si mettono dieci minuti...
P.S.
Boot stuck significa che all'avvio trovi un errore e non ti fa continuare il normale boot ( tipicamente sul display appare il robottino sdraiato con un avviso triangolare di pericolo )