Appena una pagina indietro è stato detto che la garanzia non si perde, trattandosi comunque di un firmware ufficiale.
Aggiungendo un kernel modificato (e quindi non ufficiale) invece teoricamente perdi la garanzia, ma puoi allo stesso modo togliere tale kernel e rimettere quello stock senza lasciare tracce.
Per non avere dubbi si può effettuare un completo downgrade a gingerbread, che però pare essere una procedura non tanto semplice.
O in alternativa stare fermi e attendere pazientemente l'aggiornamento via Kies o OTA.